细菌培养及菌体收集

发布时间:2023-04-27 09:22:40


基因工程实验流程参考图:



挑取单菌落于5ml2216E培养基中,8℃培养,100rpm转速,振荡120h后,12000rpm离心15min。弃去上清液,加入10mlTE洗涤离心后,用10mlTE溶解菌体,混匀,20保存备用。

细菌基因组DNA的提取
细菌基因组DNA的电泳细菌基因组DNA16srRNA片段PCR扩增
PCR产物纯化pMD18-T载体的连接
E.coli感受态制备
转化
阳性克隆筛选
碱变性法提取质粒DNA质粒DNA酶切验证确定菌株分类地位阳性克隆送样测序
序列比对以及系统发育树的建立
细菌培养及菌体收集

实验一:菌株基因组DNA的提取CTAB方法)

CTAB/NaCL溶液配制:CTAB/NaCL溶液(10%CTAB0.7MNaCL4.1gNaCL溶于80ml水中,缓慢加入10gCTAB,加热溶解
原理:采用溶菌酶破碎细菌细胞壁,加入去污剂CTABEDTA消化细胞,可使核蛋白体解析,然后使蛋白和多糖杂质沉淀,DNA进入水相,再用酚、氯仿抽提纯化。最后得到DNA

操作流程:取3.5ml菌悬液,加入184μl10%SDS,混匀,溶菌酶浓度为2mg/ml37℃温1h。加入740μl5MNaCl,再加入512μlCTAB/NaCl,混匀,65℃温育10min。加入等体积氯仿/异戊醇(24:1,混匀,10000rpm离心5min,吸取上清液。上清液中加入等体积苯酚∶氯仿∶异戊醇(25241,混匀,10000rpm离心5min,吸取上清液。加入0.6异丙醇,混匀,10000rpm离心5min,收集DNA沉淀,用70%乙醇洗涤DNA沉淀。用1mlTE溶解DNA,加入终浓度为20μg/mlRNaseA4℃溶解过夜,20℃保存。

实验二:DNA电泳鉴定1.目的
学会常用的DNA琼脂糖凝胶电泳、2.原理
DNA双螺旋分子骨架两侧带有含负电荷的磷酸根,在电场中会向正极方向移动。不同长度的DNA由于受到凝胶介质的阻力不同,表现为不同的迁移率而被分开。3.器材
电泳仪,水平凝胶电泳槽和梳子及其制胶模块,250ml三角瓶,微波炉,台式离心机,旋涡混合器,凝胶成像系统,分光光度计,微量移液取样器,1.5ml离心管,双面微量离心管架,试管架等。4.试剂
细菌基因组DNATAE电泳缓冲液,1000溴化乙锭储存液,电泳级琼脂糖粉,10样缓冲液(或6加样缓冲液)DNA分子量标准(DNA/HindIII+EcoRI5.实验准备
配制TAE电泳缓冲液(50储存液,pH8.5Tris242g57.1ml冰乙酸,37.2gNa2EDTA.2H2Oddwater定容至1L1000溴化乙锭储存液(0.5mg/ml50mg溴化乙锭溶于100mLddwater4C避光储存)10加样缓冲液(20%Ficoll4000.1mol/LNa2EDTApH8.01.0%SDS0.25%溴酚蓝)6加样缓冲液(0.25%溴酚蓝,40%蔗糖水溶液)1.5ml离心管装入铝制饭盒(灭菌)、移液器吸头装入相应的吸头盒(灭菌)6.操作步骤
1称取0.5g琼脂糖粉,放入三角瓶,加入50mlTAE电泳缓冲液(1,放入微波炉中烧开(1min50ml正好倒两块小胶。
2注意观察烧瓶中的琼脂糖粉末,待完全熔化后停止微波炉(切不可让胶溶液溢出到微波炉中!
3戴上线手套,从微波炉中取出三角瓶,置桌面上冷却致不烫手(约50-60C4把梳子插到凝胶灌制模具的正确位置后缓缓倒入胶溶液。胶溶液倒至与模具的矮边缘相平即可,不要把胶溶液溢到外面。在桌面上静置10-20分钟待胶完全凝固。(剩下的胶溶液封口后留待以后再熔化使用)
5在水平电泳槽中加满1TAE电泳缓冲液。根据电泳槽的长度把电泳仪的电压调80V,注意正负电极的位置连接正确。
6待胶完全凝固后15-20分钟)小心拔出梳子。用手指捏住模具两侧的高边缘取出模具和凝胶放入电泳槽中间的平台上,凝胶要没入电泳液中。凝胶上有样品孔的一侧要朝向电泳槽的负极。
71片光面纸(或封口膜),点6l蒸馏水、1l10加样缓冲液,再加入3lDNA溶液制成10lDNA样品。
8在凝胶上选择相邻的加样孔。用10l的吸液头分别将管中的样品加入凝胶的加样孔中(如果需要时,在相邻的加样孔中加入1.5-3lDNA分子量标准物)。加样时持移液器的手以肘部固定在桌上,用另一只手扶住这只手的手腕,以减少移液器的抖动。看到蓝色的样品吸管尖头伸进加样孔后(不能伸得太深,以免穿破凝胶的底部)缓缓将蓝色的样品压入加样孔中。切不可使蓝色样品流到孔外。
9
打开电源开关,样品将形成一条蓝色的横带向前移动(如果发现蓝色向后移动,立即关闭电源,调换电极)。电泳将进行约30min
10当蓝色的溴酚蓝迁移到距凝胶边缘1cm时,关闭电源。取出模具和凝胶。
11把凝胶小心反扣放入盛有EB的搪瓷盒中。放置约10分钟后,取出用自来冲洗

细菌培养及菌体收集

相关推荐