细菌培养及菌体收集
发布时间:2023-04-27 09:22:40
基因工程实验流程参考图:
挑取单菌落于5ml2216E培养基中,8℃培养,100rpm转速,振荡120h后,12000rpm离心15min。弃去上清液,加入10mlTE洗涤离心后,用10mlTE溶解菌体,混匀,–20℃保存备用。
细菌基因组DNA的提取
细菌基因组DNA的电泳细菌基因组DNA的16srRNA片段PCR扩增
PCR产物纯化与pMD18-T载体的连接
E.coli感受态制备
转化
阳性克隆筛选
碱变性法提取质粒DNA质粒DNA酶切验证确定菌株分类地位阳性克隆送样测序
序列比对以及系统发育树的建立
细菌培养及菌体收集
实验一:菌株基因组DNA的提取(CTAB方法)
CTAB/NaCL溶液配制:CTAB/NaCL溶液(10%CTAB,0.7MNaCL4.1gNaCL溶于80ml水中,缓慢加入10gCTAB,加热溶解;
原理:采用溶菌酶破碎细菌细胞壁,加入去污剂CTAB和EDTA消化细胞,可使核蛋白体解析,然后使蛋白和多糖杂质沉淀,DNA进入水相,再用酚、氯仿抽提纯化。最后得到DNA。
操作流程:取3.5ml菌悬液,加入184μl10%SDS,混匀,溶菌酶浓度为2mg/ml,37℃温育1h。加入740μl5MNaCl,再加入512μlCTAB/NaCl,混匀,65℃温育10min。加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),混匀,10000rpm离心5min,吸取上清液。上清液中加入等体积苯酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1,混匀,10000rpm离心5min,吸取上清液。加入0.6倍异丙醇,混匀,10000rpm离心5min,收集DNA沉淀,用70%乙醇洗涤DNA沉淀。用1mlTE溶解DNA,加入终浓度为20μg/mlRNaseA,4℃溶解过夜,–20℃保存。
实验二:DNA电泳鉴定1.目的
学会常用的DNA琼脂糖凝胶电泳、。2.原理
DNA双螺旋分子骨架两侧带有含负电荷的磷酸根,在电场中会向正极方向移动。不同长度的DNA由于受到凝胶介质的阻力不同,表现为不同的迁移率而被分开。3.器材
电泳仪,水平凝胶电泳槽和梳子及其制胶模块,250ml三角瓶,微波炉,台式离心机,旋涡混合器,凝胶成像系统,分光光度计,微量移液取样器,1.5ml离心管,双面微量离心管架,试管架等。4.试剂
细菌基因组DNA,TAE电泳缓冲液,1000溴化乙锭储存液,电泳级琼脂糖粉,10加样缓冲液(或6加样缓冲液),DNA分子量标准(DNA/HindIII+EcoRI)。5.实验准备
配制TAE