中甸牦牛mtDNA ND6和COⅢ基因遗传多样性及系统进化分析

作者：向超;钟金城;陈智华;柴志欣

作者机构：西南民族大学 动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 青藏高原研究院,四川 成都610041;西南民族大学 动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 青藏高原研究院,四川 成都610041;西南民族大学 动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 青藏高原研究院,四川 成都610041;西南民族大学 动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 青藏高原研究院,四川 成都610041

来源：家畜生态学报

ISSN：1673-1182

年：2017

卷：038

期：007

页码：9-15

页数：7

中图分类：S811.5

正文语种：chi

关键词：中甸牦牛;ND6基因;COⅢ基因;系统进化;遗传多样性

摘要：为了解中甸牦牛的遗传多样性,使其遗传资源能够得到合理开发利用,本研究对中甸牦牛15个个体mtDNA ND6基因和COⅢ基因全序列进行测定,使用MEGA5.0、DNASP5.0、Clustal X1.83等软件分析了核苷酸多样性、单倍型多样性等遗传多样性指标.结果表明:(1)中甸牦牛ND6基因全序列长528 bp,4种核苷酸T、A、G、C的平均含量为20.8%、42.2%、7.6%、29.4%,存在一定的碱基组成偏倚性;COⅢ基因全序列长度为781 bp,4种核苷酸T、A、G、C的平均比例为29.2%、26.1%、15.2%、29.5%.(2)在15个中甸牦牛个体的ND6基因序列中均未发现单倍型及变异位点,表明中甸牦牛mtDNA ND6基因的遗传多样性较为贫乏;在COⅢ基因序列中发现了3个单倍型,4个变异位点,其中2个转换,2个颠换.(3)在构建的系统进化树中,中甸牦牛首先与麦洼牦牛等家牦牛聚为一类,说明其属于家牦牛,其次与野牦牛聚为一类,说明中甸牦牛与野牦牛亲缘关系较近;由遗传距离分析可知,中甸牦牛与野牦牛距离最小,与亚洲水牛距离最大.此结果进一步支持了将牦牛和野牦牛划分为牛亚科牦牛属的观点.

中甸牦牛mtDNA ND6和CO基因遗传多样性及系统进化分析