动物

发布时间:

Real-timeqPCR检测鸡胚中贝氏隐孢子虫方法研究
摘要:为检测鸡胚中贝氏隐孢子虫,本研究根据GenBank公布的贝氏隐孢子虫和原鸡18SrRNA基因序列设计针对贝氏隐孢子虫的特异性引物,并以标准基因组DNA为模板,建立贝氏隐孢子虫SYBRGreen实时荧光定PCRReal-timeqPCR方法,并对含有贝氏隐孢子虫的鸡胚尿囊液样品进行检测。结果表明,建立的SYBRGreenReal-timeqPCR方法可特
异性扩增出贝氏隐孢子虫,而且建立的标准曲线线性关系良好(R2=0.998进一步做重复性结果显示试验重现性较好。本研究建立了快速、特异的定量检测鸡胚中贝氏隐孢子虫Real-timeqPCR方法,可用于
对贝氏隐孢子虫在鸡胚中繁殖规律分析和药物筛选评估。
关键词:Real-timeqPCR;贝氏隐孢子虫;鸡胚

隐孢子虫(Cryptosporidium是寄生于人和动物胃肠道和呼吸道上皮细胞内能引起人畜共患隐孢子虫病(cryptosporidiosis的一种原虫[1]。现今,包括中国在内,在世界6大洲90个国家300多个地区已发现隐孢子虫,其能感染包括人在内的240多种动物[2]对于免疫功能正常宿主,其主要引起自限性腹泻。对于免疫抑制患者,尤其是获得性免疫缺陷综合症AIDS
患者,感染后危害严重,且常常引起死亡[3]
贝氏隐孢子虫C.baileyi为感染鸡的优势种,主要寄生于鸡喉头、气管、法氏囊和泄殖腔等部位,可引起雏鸡呼吸道症状,导致生产性能下降甚至死亡;当与其它免疫抑制性病原混合感染时,将造成更严重的经济损失[4]世界上大多数国家均有鸡隐孢子虫病的报道,美国乔治亚州蛋鸡群感染率为10~60%,肉鸡群为41%;苏格兰鸡群感染率为88[5]。在我国,不同地域报道的鸡隐孢子虫感染率差异较大,宁夏、上海、湖南、合肥、河南等地感染率分别为27%、12.1%、36.81%、50.83%、11.40[6]。鉴于隐孢子虫病对人类健康和畜牧业生产的巨大危害,自上世纪八十年代以来隐孢子虫病研究日益成为全球范围内人兽共患病领域内的一个研究热点。们在隐孢子虫分类地位、种类鉴定、分子流行病学、传播机制、免疫机理、检测技术和药物防治等方面进行了大量的探索性研究,取得了丰硕的研究成
[7]
目前,隐孢子虫虫定量分析常用方法包括:定量PCRreal-timequantitativePCRreal-timeq-PCR、显微镜计数法(计数显微镜下每个视野中荧光标记或其它化学方法染色虫体)酶联免疫吸附分析ELISA光化学免疫分析和原位杂交比色法等[8-9]其中Real-timeqPCR不需要对产物进行电泳和密度测定,分析快速,且灵敏度高,重现性好,为目前最常用的定量分析方法。本研究利用实验室已建立的C.baileyi鸡胚培养模型,采用Real-timeqPCR方法检测鸡胚尿囊液中C.baileyi,以期建立快速准确检测鸡胚中C.baileyi的方法,为利用C.baileyi鸡胚培养模型进行
隐孢子虫药物筛选提供定量方法。

1材料和方法1.1试验时间、地点
xxxxxx



1.2试验仪器

台式离心机(型号TDL-403);OLYMPUS显微镜CX2137oC恒温培养箱;分析天平;1mL注射器;鸡胚照蛋器;打孔器;血细胞计数器;
ABI7500荧光定量PCR(美国ABI公司

1.3试验材料

1.3.1卵囊及试验动物:
1.3.1.1卵囊:实验室保存的已纯化的鸡源C.baileyi卵囊。1.3.1.2鸡胚:实验室孵化的购自新乡原阳某孵化厂非免疫鸡胚。1.3.2试验试剂DNA提取试剂盒:日本东洋坊公司(TOYOBO)生产的MagExtractorTM基因组提取试剂盒;SYBRGreenPCR试剂盒TaKaRa公司生产的SYBR?PrimexExTaqTMⅡ);注射用青霉素钠,规格100万单位,批号:100904,华北制药集团;注射用硫酸链霉素,规格100万单位,批号:100302,华北制药集团;PBS原液;孔雀绿染
色液。
1.3.3试验试剂的配制
孔雀绿染色液:孔雀绿染料1.6g,十二烷基磺酸钠10g,在100mL蒸馏
水中溶解混匀。使用时将原液稀释10倍即为工作液。PBS原液配制:NaCl:80gKCl:2.0gKH2PO4:2.0gNaH2PO4?12H2O:29g,先加入300mL双蒸水充分溶解,再定容至1000mL,配置成0.1MPBS,使用时将原液稀释10倍即为工作液。

1.4试验方法
1.4.1鸡胚接种及尿囊液收取209日龄鸡胚采用常规鸡胚尿囊腔接种方法,每枚接入0.2mL卵囊液,约含卵囊3.0×105个。7天后收取全部
鸡胚尿囊液-20℃保存备用。
1.4.2引物合成
根据GenBank发表的C.baileyiAF093495.1和原鸡AF173612.118SrRNA全基因序列,应用Oligo5.0生物学软件设计C.baileyi18SrRNA基因特异性引物,扩增片段为143bp。引物由北京鼎国昌盛生物技
术有限责任公司合成。序列如下:
F5'GTGTGTTTAACACGAGGAAGTTTTAG3'R5'CGATGTATATTCATAAGATTACCCATTT3'
1.4.3样品DNA提取及PCR扩增
样品DNA提取方法参照MagExtractorTM基因组提取试剂盒说明书进行。引物稀释:按照引物合成单说明将引物用灭菌双蒸水稀释成25μM的浓度
并置4℃冰箱保存。
PCR反应条件为:94℃预变性5min;然后40个循环(94℃,45s
62℃,45s72℃,1min;最后72℃延伸10min
25μl体系中加入以下成份:SYBRPreMix(5U/μl15μlP10.5μl

P20.5μlDNA1μlddH2O8μl

1.4.4特异性试验
C.baileyi、安氏隐孢子虫、鸡胚尿囊膜细胞、鸡胚气管环细胞、鸡柔内艾美尔球虫和大肠杆菌DNA模板均由本实验室提供,共同进行Real-time
qPCR
1.4.5标准曲线的绘制
将含106C.baileyi卵囊DNA分别稀释成含106105104103102卵囊DNA,建立C.baileyi18SrRNA基因
Real-timeqPCR标准曲线。
1.4.6重复性试验
将上述含106105104103102卵囊DNA分别扩
3次,对试验结果进行统计学分析。
1.4.7鸡胚尿囊液中C.baileyi18SrRNA基因扩增
采用上述DNA提取方法及Real-timeqPCR反应体系,进行鸡胚尿囊液中
C.baileyi18SrRNA基因扩增。
2结果与分析

2.1引物特异性试验结果
C.baileyi18SrRNA基因引物扩增C.baileyi、安氏隐孢子虫、鸡胚尿囊膜细胞、鸡胚气管环细胞、鸡柔内艾美尔球虫和大肠杆菌DNA模板,仅有C.baileyi模板能够扩增出曲线,其它试验所用模板均不能扩增出曲线,说明该引物对C.baileyi具有特异性,可以有效准确扩增出鸡胚中C.
baileyi

2.2标准曲线的绘制
106105104103102卵囊DNA绘制的C.baileyi
18SrRNA基因标准曲线线性关系良好,R2=0.998

2.3重复性试验结果
对重复性试验结果进行统计学分析,106105104103102卵囊DNA扩增后阈值Ct的平均值±标准差分别为14.25±0.0917.46±0.1520.06±0.1823.60±0.1127.03±0.07,可见试验重
复性较好。

2.4鸡胚尿囊液中C.baileyi18SrRNA基因扩增结果
对收集的鸡胚尿囊液进行Real-timeqPCR扩增结果显示该引物能够扩增出鸡胚尿囊液中C.baileyi18SrRNA基因,从溶解曲线可以看出无非特
异性扩增。
3讨论

Real-timeqPCR技术具有特异性好,准确性和灵敏度高,操作简单,自动化程度高,交叉污染和污染环境机会少等优点,其用途主要集中于3个方面。第一,定性分析:用于病毒、病原菌检测及生物品种间鉴定;第二,绝对定量:用于病毒或病原菌的定量分析。第三,相对定量:用于mRNA达量分析和siRNA效果确认等。目前,Real-timeqPCR技术在隐孢子虫
检测及药物筛选方面应用较广。

Higgins[10]研究两种商用试剂盒是否适用于从粪样中提取DNA用于荧光定量PCR,认为商用DNA提取试剂盒可以用于荧光定量PCR,最适宜于抑制因子少的样品,若样品中含有大量抑制因子则建议用巢氏PCR做进一步验证。Keegan[11]等建立TaqmanPCR技术检测细胞培养中微小隐孢子虫(C.parvum)的方法,并利用该方法检验几种常用的自来水消毒剂对隐孢子虫的影响,研究认为混合氧化剂及氯气对隐孢子虫的杀灭作用极其有限。King[12]采用TaqmanPCR技术检测细胞培养中隐孢子虫的方法,检验在不同温度保存的卵囊感染力的变化,研究认为温度越高隐孢子虫代谢越快,可以据此判断隐孢子虫的感染风险。Cai[13]采用反转录TaqmanPCR技术检测细胞培养中C.parvum的方法,检验巴龙霉素和硝唑尼特对C.parvumHCT-8细胞培养中的抑制作用。Di[14]采用TaqmanPCR技术对隐孢子虫的细胞培养方法进行了优化。目前,经改进的荧光定量方法已应用于食物水源中隐孢子虫的检测及隐孢子虫药物筛选等研究[15-16]国内对隐孢子虫荧光定量检测方法研究刚刚起步,2009年李安平等[17]基于Taq-Man探针建立了安氏隐孢子虫Real-timeqPCR检测方法,质粒DNA和卵囊的检测阈值分别达到5个拷贝和10卵囊。继而李安平等[18]建立了检测乳牛微小隐孢子虫和安氏隐孢子虫的SYBRGreenrealtimeqPCR方法,建立的荧光定量PCR快速、特异、
敏感,可用于乳牛隐孢子虫病的流行病学调查。

本试验采用C.baileyi18SrRNA基因引物扩增C.baileyi、安氏隐孢子虫、鸡胚尿囊膜细胞、鸡胚气管环细胞、鸡柔内艾美尔球虫和大肠杆菌DNA模板,仅有C.baileyi能够扩增出曲线,其它试验所用模板均不能扩增出曲线,说明该引物对C.baileyi具有特异性。106105104103102卵囊DNA绘制的C.baileyi18SrRNA基因标准曲线线性关系良好,R2=0.998扩增曲线呈现出良好的S型。106105104103102卵囊DNA重复性试验扩增,阈值(Ct)平均
±标准差分别为14.25±0.0917.46±0.1520.06±0.18
23.60±0.1127.03±0.07,试验结果重复性良好。

综上,本试验建立SYBRGreenreal-timeqPCR检测鸡胚中C.beileyi方法,引物特异性强,系标准曲线线性关良好,没有引物二聚体及非特异性扩增产物出现,可用于对C.baileyi在鸡胚中繁殖规律分析和药物筛选评估。

以上就是我为大家整理的动物医学毕业论文,希望能给你在写论文是予以帮
助。

宝贝3


动物

相关推荐