CAP-CTM48 SOP 详细操作流程

发布时间:2016-05-31 10:02:28

COBAS AmpliPrep /COBAS TaqMan 48

Standard Operating Procedures

标准操作流程

Version 1.0



1 COBAS AmpliPrep /COBAS TaqMan 48的配置如下

配置

COBAS TaqMan COBAS TaqMan 48 的转移模式

各种实验所需的架子和耗材

COBAS AmpliPrep 仪器上的相应位置

COBAS AmpliPrep _ COBAS TaqMan 48

通过K-carrier 架手工转移K-carrier COBAS TaqMan 48

a. K-tubes放在样本架上

b. 带有K-tips K-tip

c 将带有样本或质控的S-tubes 放在

样本架上

d. 带有SPUs SPU-

e. CS1放在一个试剂架

f. CS2, CS3, CS4放在一个试剂架

g. 将空的K-carrier 放在

K-carrier 架上

样本核酸提取完成后:

K-carrier上的K-tubes 手工转移

F-H

M-P

F-H

J-L

A

B-E

M-P



(M-P)

2. COBAS AmpliPrep / COBAS TaqMan 48上使用试剂及耗材的保存及注意事项:

1). 所有试剂HBV/HCV/HIV-1 test试剂)2-8℃保存,即拿即用

2). 试剂启用后,HBV2.0可保存63 days (2-8)

3). 试剂启用后,在Cobas Ampliprep上累计使用时间最多64 hrs

4). CTM(-)阴性质控L(+)弱阳性质控 H(+)强阳性质控,使用后的扔掉;

5). 洗液2-30℃保存,打开后可使用28 days

6). 耗材(S-tube/样本条码/K-tip/K-tube/SPU)常温保存。

3. COBAS AmpliPrep /COBAS TaqMan 48上使用样本的保存、运输及注意事项:

1). HBVHIV检测所需要的样本为EDTA-血浆;HCV检测所需要的样本为EDTA-血浆或血清。

2). 全血在225 ℃下运输,24hrs (HBV DNA检测)6hrs(HIV-1 RNA HCV RNA

检测) 收集出血浆 (室温800-1600g离心 20分钟)

3). HBV DNA检测:血浆可在室温下(25-30 )保存最多3天,在28 ℃最多保存7天,

或者-20~-80 ℃下长期保存,至少6周;

HCV RNA检测:血浆可在28 ℃最多保存3天,或者-70 或更低温度长期保存

HIV-1 RNA检测:血浆可在室温下(25-30 )保存最多1天,在28 ℃最多保存5天,

或者-20~-80 ℃下长期保存;

4). 血浆样本建议1100-1200 μL进行保存;

5). 血浆冷冻时,最多冻融5次不损失HBV DNA最多冻融2次不损失HCV RNA最多冻

5次不损失HIV-1 RNA

6). 标本的运输:

HBV DNA检测和HIVRNA检测 :全血必须在2~25°C运送,血浆可在2~8°C或在-20°C-80°C冷冻运送。

HCV RNA检测 : 全血必须在2~25°C运送,血浆可在2~8°C或在-70°C冷冻运送。



4. COBAS AmpliPrep / COBAS TaqMan 48

HBV DNA/HCV RNA/HIV-1 RNA 定量检测操作流程:

A

仪器初始化及维护

A1

打开COBAS AmpliPrep COBAS TaqMan48 开关,等待仪器初始化完成,为 stand-by 状态。

A2

登陆电脑及 AMPLILINK 软件

(建议电脑应该每日关机)

a) 登陆Windows® XP操作系统( User ID password

b) 双击桌面上AMPLILINK 软件图标

c) 登陆AMPLILINK 软件( User ID password

A3

通过软件Status界面检查洗液量是否足够,如不够需要更换新的洗液

A4

检查软件维护界面Due 按钮下列出的需要进行的维护内容,按照维护手册进行相应内容的维护工作

COBAS AmpliPrep 仪器自动进行系统初始化工作

B

加载试剂

将所有试验需要的试剂匣从 2-8°C 冰箱拿出,立即放在试剂架上并放入 COBAS AmpliPrep 仪器中,试验开始前在仪器上平衡至少30分钟。不要将试剂匣放在仪器外进行温度平衡,以免在试剂匣表面形成水凝结,造成条码的损坏。如果在试剂匣表面有水凝结,不要对条码部位进行擦拭,以免损坏条码造成仪器无法对条码进行辨识。

B1

CS1 试剂匣放在一个试剂架上,将试剂匣 CS2, CS3 CS4 放于另一个试剂架上

B2

将放有CS1的试剂架放入到COBAS AmpliPrep 仪器中的A位置

B3

将放有CS2, CS3 CS4的试剂架放入到COBAS AmpliPrep仪器中的BCDE的任一位置



C

加载耗材

注意:根据检测的样本数计算需要的COBAS AmpliPrep 试剂匣数目, 样本处理单元(SPU), 样本管(S-tube), K-枪头(K-tips) K-(K-tubes) 的数量。 每个样本或质控分别需要 一个SPU, 一个S-tube, 一个K-tip 和一个K-tube

C1

加载样本处理单元 (SPUs)

计算需要SPU数量,一个样本或质控需要一个SPU

SPUs 放入到SPU 架中

向下压SPU的边缘部分(不要碰到S-tip的部分)使SPU完全坐稳在SPU架的

底部

确认 SPUs 正确的放入在SPU 架中

(SPUs放置不正确,可能造成仪器运行中停止)

SPU 架放入到COBAS AmpliPrep仪器的 J, K L位置

C2

将空的K-carriers K-carrier 架关联,放在COBAS AmpliPrep O ,P 位置

C3

加载K-tip 架于COBAS AmpliPrep M, N位置

D

创建命令和加载样本

D1

样本架准备

将样本的条码夹放在样本架上相应有样本管 (S-tube)的地方

将专用于质控的条码夹放在样本架上与阴性质控(-) C, 弱阳性质控L(+)

强阳性质控相对应的地方

注意对相应的质控使用正确的质控条码夹

D2

& D3

通过AMPLILINK 软件创建命令 (见下图)

在软件orders界面下的Sample rack 按钮下创建样本及质控的命令

选择相应的检测项目,并进行保存

打印创建好的样本及质控工作表



D4

&

D5

在生物安全柜中进行样本准备

涡旋混匀样本及质控3-5

1000 µl 样本及质控转移到相应的样本管S-tube

避免将颗粒或凝块状物质转移到样本管S-tube

装有样本及质控的样本管放到样本架相应的位置(与创建好的命令工作表

中的位置一致)

确保质控条码上的lot 号码与质控的lot 号码一致

确保相应的质控使用正确的质控条码夹

避免样本或质控污染样本管S-tube的上部

转移每个样本或质控需要一个新的加样枪头

D6

加载带有样本管和K-tubes的样本架于COBAS AmpliPrep 仪器的F, G H位置

K-tube需要放置于样本架上相应的样本管旁边的位置上

E

开始运行COBAS AmpliPrep 仪器

E1

AMPLILINK 软件上启动运行COBAS AmpliPrep

检查Status 界面下,确保没有样本、质控或试剂被锁住

确保所有的样本和耗材都已加载到COBAS AmpliPrep

点击Start 按钮

F

COBAS AmpliPrep 仪器运行结束后, 手工转移提取好的样本到 COBAS TaqMan48

应避免将所有提取好的样本及质控直接放置于日光或光源下

F1

检查AMPLILINK 软件中可能显示的标记flags及错误信息

F2

COBAS AmpliPrep处理好的样本及质控120 分钟内转移到COBAS TaqMan 48 中开始反应

不要冷冻或在2-8°C储存处理好的样本及质控

F3

通过K-carrier 转移工具,手工转移带有 K-carrier K-carrier 架到COBAS TaqMan 48

F4

丢弃COBAS AmpliPrep 仪器中的废物



G

开始运行COBAS TaqMan 48

G1

系统自动开始COBAS TaqMan 48 运行

如果K-carrier上的K-tube数目少于6,需要用空的K-tube填补K-carrier上空缺位置,AMPLILINK软件会指导需要填补的位置。打开扩增仪的外部盖子,将 K-carrier 放入到扩增模块中并关闭盖子,开始运行COBAS TaqMan 48

H

COBAS TaqMan 48 运行结束

H1

运行结束,打印结果报告

检查结果中的标记flags 或错误信息

接受结果,数据自动备份(archive)

H2

将检测完毕的K-tubes COBAS TaqMan 48中拿出,根据实验室规定进行相应处理或丢弃

CAP-CTM48 SOP 详细操作流程

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