CAP-CTM48 SOP 详细操作流程
发布时间:2016-05-31 10:02:28
发布时间:2016-05-31 10:02:28
COBAS AmpliPrep /COBAS TaqMan 48
Standard Operating Procedures
标准操作流程
Version 1.0
1. COBAS AmpliPrep /COBAS TaqMan 48的配置如下:
配置 | 到COBAS TaqMan 或COBAS TaqMan 48 的转移模式 | 各种实验所需的架子和耗材 | 在COBAS AmpliPrep 仪器上的相应位置 |
COBAS AmpliPrep _ COBAS TaqMan 48 | 通过K-carrier 架手工转移K-carrier 到COBAS TaqMan 48 中 | a. K-tubes放在样本架上 b. 带有K-tips 的K-tip 架 c 将带有样本或质控的S-tubes 放在 样本架上 d. 带有SPUs 的SPU-架 e. CS1放在一个试剂架 f. CS2, CS3, CS4放在一个试剂架 g. 将空的K-carrier 放在 样本核酸提取完成后: K-carrier上的K-tubes 手工转移 | F-H M-P F-H J-L A B-E M-P
|
2. COBAS AmpliPrep / COBAS TaqMan 48上使用试剂及耗材的保存及注意事项:
1). 所有试剂(HBV/HCV/HIV-1 test试剂)2-8℃保存,即拿即用;
2). 试剂启用后,如HBV2.0可保存63 days (2-8℃);
3). 试剂启用后,在Cobas Ampliprep上累计使用时间最多64 hrs;
4). CTM(-)阴性质控、L(+)弱阳性质控、 H(+)强阳性质控,使用后的扔掉;
5). 洗液2-30℃保存,打开后可使用28 days;
6). 耗材(S-tube/样本条码/K-tip/K-tube/SPU)常温保存。
3. COBAS AmpliPrep /COBAS TaqMan 48上使用样本的保存、运输及注意事项:
1). HBV和HIV检测所需要的样本为EDTA-血浆;HCV检测所需要的样本为EDTA-血浆或血清。
2). 全血在2~25 ℃下运输,24hrs内 (HBV DNA检测)或6hrs内(HIV-1 RNA或 HCV RNA
检测) 收集出血浆 (室温800-1600g离心 20分钟);
3). HBV DNA检测:血浆可在室温下(25-30 ℃)保存最多3天,在2~8 ℃最多保存7天,
或者-20~-80 ℃下长期保存,至少6周;
HCV RNA检测:血浆可在2~8 ℃最多保存3天,或者-70 ℃或更低温度下长期保存;
HIV-1 RNA检测:血浆可在室温下(25-30 ℃)保存最多1天,在2~8 ℃最多保存5天,
或者-20~-80 ℃下长期保存;
4). 血浆样本建议1100-1200 μL进行保存;
5). 血浆冷冻时,最多冻融5次不损失HBV DNA,最多冻融2次不损失HCV RNA,最多冻
融5次不损失HIV-1 RNA;
6). 标本的运输:
HBV DNA检测和HIVRNA检测 :全血必须在2~25°C运送,血浆可在2~8°C或在-20°C到-80°C冷冻运送。
HCV RNA检测 : 全血必须在2~25°C运送,血浆可在2~8°C或在-70°C冷冻运送。
4. COBAS AmpliPrep / COBAS TaqMan 48
HBV DNA/HCV RNA/HIV-1 RNA 定量检测操作流程:
A | 仪器初始化及维护 | |
A1 | 打开COBAS AmpliPrep 和 COBAS TaqMan48 开关,等待仪器初始化完成,为 stand-by 状态。 | |
A2 | 登陆电脑及 AMPLILINK 软件 (建议电脑应该每日关机) a) 登陆Windows® XP操作系统( User ID 和 password) b) 双击桌面上AMPLILINK 软件图标 c) 登陆AMPLILINK 软件( User ID 和 password) | |
A3 | 通过软件Status界面检查洗液量是否足够,如不够需要更换新的洗液 | |
A4 | 检查软件维护界面Due 按钮下列出的需要进行的维护内容,按照维护手册进行相应内容的维护工作 COBAS AmpliPrep 仪器自动进行系统初始化工作 | |
B | 加载试剂 将所有试验需要的试剂匣从 2-8°C 冰箱拿出,立即放在试剂架上并放入 COBAS AmpliPrep 仪器中,试验开始前在仪器上平衡至少30分钟。不要将试剂匣放在仪器外进行温度平衡,以免在试剂匣表面形成水凝结,造成条码的损坏。如果在试剂匣表面有水凝结,不要对条码部位进行擦拭,以免损坏条码造成仪器无法对条码进行辨识。 | |
B1 | 将CS1 试剂匣放在一个试剂架上,将试剂匣 CS2, CS3 和CS4 放于另一个试剂架上 | |
B2 | 将放有CS1的试剂架放入到COBAS AmpliPrep 仪器中的A位置 | |
B3 | 将放有CS2, CS3 和 CS4的试剂架放入到COBAS AmpliPrep仪器中的B、C、D、E的任一位置 | |
C | 加载耗材 注意:根据检测的样本数计算需要的COBAS AmpliPrep 试剂匣数目, 样本处理单元(SPU), 样本管(S-tube), K-枪头(K-tips) 和 K-管(K-tubes) 的数量。 每个样本或质控分别需要 一个SPU, 一个S-tube, 一个K-tip 和一个K-tube 。 | |
C1 | 加载样本处理单元 (SPUs) ∙ 计算需要SPU数量,一个样本或质控需要一个SPU ∙ 将SPUs 放入到SPU 架中 ∙ 向下压SPU的边缘部分(不要碰到S-tip的部分)使SPU完全坐稳在SPU架的 底部 ∙ 确认 SPUs 正确的放入在SPU 架中 (若SPUs放置不正确,可能造成仪器运行中停止) ∙ 将SPU 架放入到COBAS AmpliPrep仪器的 J, K 或 L位置 | |
C2 | 将空的K-carriers 与K-carrier 架关联,放在COBAS AmpliPrep 的O ,P 位置 | |
C3 | 加载K-tip 架于COBAS AmpliPrep 上M, N位置 | |
D | 创建命令和加载样本 | |
D1 | 样本架准备 ∙ 将样本的条码夹放在样本架上相应有样本管 (S-tube)的地方 ∙ 将专用于质控的条码夹放在样本架上与阴性质控(-) C, 弱阳性质控L(+) 和 强阳性质控相对应的地方 ∙ 注意对相应的质控使用正确的质控条码夹 | |
D2 | 通过AMPLILINK 软件创建命令 (见下图) ∙ 在软件orders界面下的Sample rack 按钮下创建样本及质控的命令 ∙ 选择相应的检测项目,并进行保存 ∙ 打印创建好的样本及质控工作表 | |
D4 & D5 | 在生物安全柜中进行样本准备 ∙ 涡旋混匀样本及质控3-5秒 ∙ 将1000 µl 样本及质控转移到相应的样本管S-tube中 ∙ 避免将颗粒或凝块状物质转移到样本管S-tube中 ∙ 装有样本及质控的样本管放到样本架相应的位置(与创建好的命令工作表 中的位置一致) ∙ 确保质控条码上的lot 号码与质控的lot 号码一致 ∙ 确保相应的质控使用正确的质控条码夹 ∙ 避免样本或质控污染样本管S-tube的上部 ∙ 转移每个样本或质控需要一个新的加样枪头 | |
D6 | ∙ 加载带有样本管和K-tubes的样本架于COBAS AmpliPrep 仪器的F, G 或 H位置 ∙ K-tube需要放置于样本架上相应的样本管旁边的位置上 | |
E | 开始运行COBAS AmpliPrep 仪器 | |
E1 | 在AMPLILINK 软件上启动运行COBAS AmpliPrep ∙ 检查Status 界面下,确保没有样本、质控或试剂被锁住 ∙ 确保所有的样本和耗材都已加载到COBAS AmpliPrep中 ∙ 点击Start 按钮 | |
F | COBAS AmpliPrep 仪器运行结束后, 手工转移提取好的样本到 COBAS TaqMan48 应避免将所有提取好的样本及质控直接放置于日光或光源下 | |
F1 | ∙ 检查AMPLILINK 软件中可能显示的标记flags及错误信息 | |
F2 | ∙ 在COBAS AmpliPrep处理好的样本及质控必须在120 分钟内转移到COBAS TaqMan 48 中开始反应 不要冷冻或在2-8°C储存处理好的样本及质控 | |
F3 | ∙ 通过K-carrier 转移工具,手工转移带有 K-carrier 的 K-carrier 架到COBAS TaqMan 48 中 | |
F4 | 丢弃COBAS AmpliPrep 仪器中的废物 | |
G | 开始运行COBAS TaqMan 48 | |
G1 | 系统自动开始COBAS TaqMan 48 运行 | |
∙ 如果K-carrier上的K-tube数目少于6个,需要用空的K-tube填补K-carrier上空缺位置,AMPLILINK软件会指导需要填补的位置。打开扩增仪的外部盖子,将 K-carrier 放入到扩增模块中并关闭盖子,开始运行COBAS TaqMan 48 | ||
H | COBAS TaqMan 48 运行结束 | |
H1 | ∙ 运行结束,打印结果报告 | |
∙ 检查结果中的标记flags 或错误信息 | ||
∙ 接受结果,数据自动备份(archive) | ||
H2 | ∙ 将检测完毕的K-tubes 从COBAS TaqMan 48中拿出,根据实验室规定进行相应处理或丢弃 | |